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| Muestras de plancton©Tara Expeditions |
En oportunidad de
la escala en Villefranche-sur-Mer, entre estación zoológica creada en 1884 y antigua cárcel de los reyes de Cerdeña, la tripulación
ha visitado el Observatorio Oceanográfico. Nos hemos encontrado con varios
científicos embarcados en Tara en expediciones pasadas. Entre ellos,
Jean-Baptiste Romagnan, ingeniero especializado en el análisis del plancton por
sistemas de imagen. El sigue procesando datos de Tara Oceans (2009-2012), una aventura
científica global en la cual él ha
participado dos veces.
¿En qué periodos se ha unido a Tara Oceans?
La primera vez
fue para mi tesis en octubre de 2009, entre Nápoles y Malta, la segunda vez en
el otoño de 2011 entre la isla de Ascensión y Río. En 2009, estábamos todavía en
una fase preparatoria. Junto a la ingeniera Sarah Searson, yo me encargaba en
cubierta de la recolección de zooplancton con las redes. En 2011, yo trabaje también
en el muestreo con redes y el despliegue de los demás dispositivos.
¿Cómo se procesan los productos del muestreo?
Hemos recogido numerosas
muestras, unos tubos que contienen el plancton recolectado en Tara Oceans y
Tara Oceans Polar Circle (2013); Y se sumaran más muestras recogidas en los
próximos meses en el Mediterráneo. En el laboratorio, se analizan de varias
maneras: algunos científicos trabajan la genética, otros analizan por medio de
imágenes. Esto es lo que hago en las muestras de de Tara Oceans con el zooscan,
un escáner de plancton. Desde hace casi 5 años, hemos procesado aproximadamente el 75% de los datos recogidos.
El procedimiento es siempre el mismo: quitar la formalina, tomar una porción de
la muestra para colocarla el zooscan, obtener imágenes, o sea unas imágenes en miniatura de cada objeto a partir
de la gran imagen escaneada. Estas imágenes son analizadas, y a partir de de
las mediciones hacemos un "aprendizaje automático", pedimos al
ordenador identificar el plancton antes de confirmar las identificaciones de
forma manual. Antes, eso se hacía con un microscopio de disección, se necesitaba
tiempo y mucha experiencia. En la actualidad, hemos desarrollado herramientas
que nos permiten avanzar más rápido y analizar un gran número de muestras.
¿Cuantos datos archivados por un lote de muestras?
Miles de
millones! El Zooscan es una herramienta desarrollada para satisfacer diversas
necesidades. La primera: generar los datos de las campañas oceanográficas poco
después de la recolección, ya que en el pasado ello tardaba varios años. La
segunda: responder a una necesidad de almacenamiento; Las muestras en tubos no
son eternas, pueden sufrir daños y accidentes. Archivar los datos de forma digital
nos permite almacenar esos datos en varios lugares en una lógica de
conservación. La tercera necesidad responde a las problemáticas científicas,
como la medición de de la biomasa, la medición del biovolumen, la medición del
tamaño o espectro de tamaño. De hecho, con las imágenes, podemos medir de forma
automática cada organismo y obtener mediciones precisas y homogéneas. A partir
de estas mediciones, derivamos información sobre el funcionamiento de los
ecosistemas. El plancton se puede ver a través de los "lentes de la
biodiversidad" o a través del lente de la "estructura en tamaño”,
para responder a diferentes preguntas: ¿cuánto hay, por qué, dónde? etc.
Se trata de una expedición
excepcional! Al igual que Tara Oceans Polar
Circle. Son dos expediciones inéditas: un tipo de aventura científica que no se
había hecho durante décadas, incluso siglos, algo que se une a las grandes
expediciones naturalistas como las de Darwin o de Challenger. La idea original
era de muestrear toda la vida planctónica, no solo el plancton sino todos los organismos: de los virus
y bacterias hasta los organismos más grandes del plancton gelatinoso. El
objetivo era desarrollar un muestreo de toda la diversidad biológica y la
complejidad del plancton para hacer un inventario "fotográfico" de la
biodiversidad del plancton en la escala global. Después de expediciones de este tipo siguen décadas de
trabajo. Los análisis están en curso, tanto aquí como en la Estación biológica de
Roscoff, un laboratorio asociado, y en otros laboratorios.
¿Cuál ha sido su experiencia con Tara?
Mis embarques han
sido experiencias geniales! Tara es un velero
grande pero un barco pequeño en comparación con los barcos oceanográficos usuales.
Realizar una campaña oceanográfica en esta goleta, un muestreo complejo y
completo, es una hermosa hazaña. Este es otro enfoque de la oceanografía, algo bastante
intenso. Trabajamos mas en grupo, interactuamos con los socios del consorcio
Tara Oceans, nos reunimos varias veces al año y tratamos de hacer ciencia de
forma colectiva. Eso es muy estimulante, esta comunidad es muy entrañable. Personalmente,
como científico, he crecido con Tara, es un proyecto formador y sigo trabajando
sobre estos datos.
Entrevista realizada por Noélie Pansiot
